解決

...しかし、問題は直ってなかった。

デフォルトの設定にしてみると新たにセカンダリのキーが自動的に設定されていたので、ひょっとして自分でバインドできるのかと思って試してみたところ、うまくいった。
マニュアルにはコマンダーのキーは変えられないとかかれていたが、違うらしい。
一応目的の作業はできるようになったが、問題を回避しただけ。なんだかすっきりしない。

で、SetPointを戻そうかとも思ったが、無しのほうが微妙に軽快なのでこのままにしとこう。