コンソールから作業すると全部root権限になってしまうのだが

普通に使っていてもユーザー権限とroot権限の両方を使うことになってしまうのは、仕組みとしてどうなんだろう。
文字どおりパーソナルに使うのであればrootがあると邪魔くさいと考えたのかもしれないが、きっちりわけておいた方がわかりやすいような気がする。