Ubuntu11.04でオーディオ出力に激しいノイズが入る

起動して何か音のでるものを使うとノイズが入る。
しかしPulseaudioの設定UIを起動すると綺麗に音が出るようになる。
起動時に読み込まれるべき設定がきちんと読み込まれていない感じなのだが、どこを直せばいいのかはまだ知らない。

追記：VLCの問題だった。